در دفاتر حسابداری ،مالیات بر ارزش افزوده پرداختی، هزینه یا خرید محسوب نمیشود بلکه به حساب بدهی وزارت دارایی ثبت می شود بنابراین قیمت خرید کالا بر اساس قیمت پروفرم و هزینه های مرتبط به واردات کالا از جمله حقوق ورودی در دفاتر درج میگردد. هنگام فروش کالا 3% ازقیمت فروش به عنوان مالیات بر ارزش افزوده در فاکتور فروش درج و از خریدار اخذ خواهد گردید که در دفاتر به عنوان بستانکاری وزارت دارایی از شما درج میگردد و هر 3 ماه یکبار چنانچه حساب مذکور دارای مانده بستانکار باشد مانده مذکور به عنوان مالیات بر ارزش افزوده به حساب وزارت دارایی واریز خواهد گردید.